Фонд поддержки прикладных экологических разработок и исследований «Озеро Байкал» учрежден 22 ноября 2016 года как независимая некоммерческая организация, которая специализируется на стратегическом управлении водными ресурсами и изучении озера Байкал.

Целью работы Фонда является содействие естественнонаучным, гуманитарным проектам и инициативам, которые направлены на сохранение и развитие Байкальской природной территории. Миссия Фонда - сохранить Байкал, создавая условия для устойчивого управления водными ресурсами на национальном и международном уровнях.

В настоящее время в тесном сотрудничестве с ведущими специалистами и учеными Фонд реализует проекты и программы по следующим направлениям: сохранение водных ресурсов; сохранение биологического разнообразия; устойчивый туризм и ответственное обращение с отходами потребления; экологическое образование. Все эти направления отвечают глобальным Целям устойчивого развития ООН № 4, 6, 12, 15, 17, а также Национальным целям развития России до 2030 года, закрепленным Указом Президента РФ от 21.07.2020.

Фонд способствует продвижению принципов рационального управления водными ресурсами и поддерживает научные исследования, посвященные оценке состояния воды в озере Байкал.

Через грантовую поддержку научно-исследовательских институтов и молодых ученых Фонд реализует проекты по комплексному изучению и сохранению эндемичных видов животных озера Байкал: Фонд является единственной организацией, комплексно изучающей популяцию байкальской нерпы. Фонд реализует проекты по мониторингу и реинтродукции в естественную среду обитания и других эндемиков, например, ольхонской полевки.

Фонд развивает устойчивый туризм и раздельных сбор отходов на особо охраняемых природных территориях (ООПТ) Байкальского региона в рамках программы «Национальные парки без мусора». В 2020 году рамках Форума Агентства стратегических инициатив «Сильные идеи для нового времени» генеральный директор Фонда Анастасия Цветкова обратилась к Президенту РФ с предложениями по совершенствованию систем управления отходами потребления на ООПТ, в т. ч. в заповедниках и национальных парках. По итогам Форума предложения вошли в Перечень поручений Президента РФ. Фонд входит в рабочую группу по разработке дорожной карты по исполнению п. 6 Поручения Президента РФ от 19.12.2020.

Фонд состоит в экспертном совете по национальному проекту «Экология» (направление «Сохранение озера Байкал») при Правительстве РФ, а также входит в экспертный совет АСИ и в состав бассейнового совета Ангаро-Байкальского бассейнового округа. На международном уровне Фонд имеет статус наблюдателя Программы ООН по окружающей среде (ЮНЕП), а также является единственной российской некоммерческой организацией, представленной во Всемирном водном совете (World Water Council). Участие Фонда в советах имеет максимально конструктивный характер и соответствует международным тенденциям вовлечения независимых экспертных центров в разработку решений в области охраны окружающей среды.