Организация официально зарегистрирована 4 февраля 2016 года.Идея ее создания приходится на лето 2015 года, когда команда единомышленников пришла к мысли о необходимости создания организации, профилем которой стала бы деятельность по профилактике социально-значимых заболеваний и продвижению идей сохранения здоровья и достоинства среди так называемых «труднодоступных групп населения», имеющих высокие риски инфицирования, вкупе с недостаточным для сохранения своего здоровья уровнем доступа к медицинским и социальным услугам. Сотрудники ИРОО «ЦСП «Навигатор» – настоящие профессионалы, вовлеченные в тему профилактики социально значимых заболеваний уже более 10 лет, имеющие значительный опыт реализации самых разных программ по профилактике и пропаганде здорового и ответственного образа жизни, направленных на работу с различными группами населения – от школьников и до потребителей наркотиков. Сейчас Центр работает над проектом«Клуб «Волонтер. Общество. Здоровье.", который реализуется при поддержке и с использованием средств гранта Президента Российской Федерации на развитие гражданского общества, предоставленного Фондом президентских грантов. Волонтерский проект нацелен на профилактику соц.значимых заболеваний(Вич-инфекция и туберкулез) среди молодежи руками самой молодежи, ведь волонтеры проекта такие же представители современной молодежи.