Домодедовская таможня — это специализированный таможенный орган, который входит в единую федеральную централизованную систему таможенных органов Российской Федерации. В рамках своей компетенции она выполняет задачи и функции Федеральной таможенной службы России на территории своего региона.
История Домодедовской таможни берёт своё начало с приказа Главного Управления Государственного Таможенного Комитета при Совете Министров СССР от 10 февраля 1989 года № 28 «О создании Домодедовского таможенного поста Шереметьевской таможни».
Домодедовская таможня появилась 13 мая 1994 года на основе Домодедовского таможенного поста Шереметьевской таможни. Её создание было официально оформлено приказом Председателя Государственного таможенного комитета Российской Федерации от 13 мая 1994 года № 198 «О создании Домодедовской таможни».
Также была определена зона деятельности таможни — аэропорт Домодедово.