Верхошижемский краеведческий музей был основан 26 февраля 1972 года. Постоянного здания для размещения экспозиций не было, только временные помещения для хранения экспонатов. Однако велась активная работа с населением и даже проводились экскурсии. В районной газете появилась страница «Знай и люби свой край», которую готовили активисты Совета музея.
3 февраля 1978 года музей был открыт для посетителей в двух залах Дома пионеров. На момент открытия его фонд составлял около 1 000 экспонатов и 300 фотографий. В основном были собраны орудия труда сельскохозяйственного производства и предметы домашнего обихода. На общественных началах музей работал 14 лет. Краеведы продолжали активную работу по сбору материалов, сотрудничали с районной газетой.
В 1992 году Верхошижемский музей стал государственным. Его экспозиции были развернуты в отремонтированном здании бывших яслей. В 1998 году решением Верхошижемской районной Думы учреждению было присвоено имя Александра Николаевича Зайцева.
В настоящий момент Верхошижемский районный краеведческий музей им. Александра Зайцева располагается в доме станового пристава, построенном в 1897 году. В фондах музея более 8 тысяч экспонатов. В экспозициях отражены быт и история края, растительный и животный мир, трудовые и ратные подвиги земляков, вехи развития района. Ежегодно музей посещают около 7 000 человек.
Верхошижемский музей является одним из организаторов социально-значимых мероприятий района. Для качественной организации подобных мероприятий работникам музея удалось сплотить вокруг себя дружный коллектив единомышленников-волонтёров, увлечённых общей идеей. Волонтёрская деятельность - важная составляющая работы учреждения, основная движущая сила. Её целями являются вовлечение молодёжи в общественную жизнь, создание и реализация социальных проектов, пропаганда краеведения. Добровольчеством в музее охвачены все возрастные группы населения.
Популярность учреждения растёт. Большое значение отводится патриотическому воспитанию детей и молодёжи. Проводятся акции по благоустройству обелисков землякам-Героям Советского Союза и мемориала воину-освободителю. Разрабатываются и проводятся военно-исторические квесты. Уделяется большое внимание и изучению традиций и ремёсел Верхошижемского района. Организовано плодотворное сотрудничество с образовательными учреждениями, администрацией Верхошижемского поселения. Отмечается стабильная положительная динамика основных показателей работы музея. Учреждение принимает активное участие в общественной жизни Верхошижемского района.
В 2017-2019 годах учреждение реализовало проект по реконструкции музея «Дверь в историю» в рамках ППМИ (проектов по поддержке местных инициатив), а также проекты по основной деятельности - «Выездной краеведческий мини-музей «Сказочная старина», «Молодёжные интеллектуальные игры», ставшие популярными не только среди молодых людей, но и у жителей района разных возрастов, проект «Лето с музеем», направленный на создание цикла познавательных онлайн-занятий для детей по крестьянскому быту.
В 2021 году началась работа по освоению грантовой деятельности. Были подготовлены два проекта: первый - «Добрые нити» в благотворительную программу «Музеи русского севера» компании «Северсталь», второй - «Музейный двор» в Президентский фонд культурных инициатив. Также учреждение выступило партнёром грантового проекта «Гончарная сказка Шижмы» Дома детского творчества. Оба проекта и проект-партнёр стали победителями. В 2022 году начата их реализация. Проект «Добрые нити» включает в себя изучение вятского народного костюма и традиций ткачества в Верхошижемском районе. А «Музейный двор» - создание на территории учреждения инновационной краеведческой площадки, которая станет платформой для проведения мероприятий, направленных на сохранение и распространение истории края, народных традиций, обрядов, ремёсел.
На базе музея в настоящий момент действуют пять объединений: кружок «Школа юного экскурсовода» - для школьников и студентов от 9 до 18 лет; клуб «У самовара»; объединение «Молодёжный библиосейшн», с помощью которого организуется полезный досуг и активный отдых молодых людей; любительское объединение «Вдохновение», реализующее программу народных художественных промыслов; краеведческая гостиная «Душевная пятница». Традиционно музеем проводятся значимые акции: «Военная полуторка», «Песни и стихи Победы», «Обелиск у дороги» (уборка территории вокруг памятников героям Советского Союза Храмцову С.В. и Макарову В.И.), всенародная акция «Свеча памяти».