Лицей ведет углубленную подготовку по физике, математике, информатике и плодотворно сотрудничает с Нижегородским государственным университетом им. Н.И.Лобачевского (ННГУ им. Н.И.Лобачевского) и Федеральным исследовательским центром Институтом прикладной физики Российской академии наук (ФИЦИПФ РАН).
Генеральную линию развития образовательного учреждения определяет Совет, в состав которого входят представители соучредителей (ИПФ РАН, ННГУ им. Н.И.Лобачевского), учащихся, учителей и родителей.
Высшим результатом научной и учебной работы являются победы учащихся Лицея №40 на международных олимпиадах.